99%的宮頸癌是由人乳頭瘤病毒(HPV)引起的。目前已經發現200多種HPV，其中一些與不同程度的癌癥風險相關，使診斷和治療變得復雜。在Elsevier出版的“分子診斷學雜志”的一篇報道描述了一種新的“二合一”診斷方法，該方法不僅可以檢測HPV感染的類型，還可以指示癌前標記物。該測試可以提高診斷風險最高形式的HPV感染的能力，以低成本提供快速結果，并幫助避免不必要的診斷程序。

　　“我們開發了HPV RNA-Seq，一種新型的體外分子診斷程序，用于檢測高危HPV感染，并鑒定高級別鱗狀上皮內病變(HSIL，這是宮頸癌的一個癌前期變化)患者。HPV RNA-Seq是一項獨特的測試，結合了分子檢測(HPV分型)和宮頸細胞學(細胞表型分析)的優勢，”巴斯德研究所的Marc Eloit博士說。

　　宮頸癌篩查可以在癌癥發生前檢測和治療癌前病變。目前，篩查要么側重于檢測HPV，要么通過細胞學鑒定異常宮頸細胞。然而，檢測病毒的DNA或RNA的分子診斷試驗在識別癌癥或癌前病變方面效果不佳。使用巴氏試驗對宮頸細胞進行分析，即使與高風險HPV的分子檢測相結合，也會導致大量不必要的陰道鏡檢查——這是一種侵入性檢查，醫生通過該檢查可視地檢查宮頸病變。

　　在這項概念驗證研究中，HPV RNA-Seq用于分析來自55名患者的樣本，28名患有低度鱗狀上皮內病變(LSIL)和27名患有癌前HSIL的患者。

　　HPV RNA-Seq能夠檢測和確定16個高危hpv患者的hpv感染類型，其結果與廣泛使用和官方批準的HPV DNA分子診斷試劑盒相當。事實上，HPV RNA-Seq檢測到的hpv陽性患者比dna檢測多2例，并且還發現了更多患有多種HPV感染的患者。

　　發現該試驗具有97.3%的敏感性(檢測HPV存在的能力)和93.8%的陰性預測值(NPV，沒有HPV的可能性)。Eloit教授指出：“高效宮頸癌篩查需要對高風險HPV感染具有高敏感性和NPV，因為HPV檢測陰性的女性通常在幾年后才再次接受檢測。”

　　細胞學被用作對HPV患者進行分類的快速方法，而組織學被認為是宮頸癌診斷的金標準。然而，組織學分析更具侵入性，需要更多時間才能產生結果。為了確定新的測試是否在宮頸癌分類中占有一席之地，研究人員還將細胞學與HPV RNA-Seq進行了比較，并發現了高級細胞學的標記，這鼓勵了HPV RNA-Seq作為分類檢測的診斷性能。他們還發現HPV RNA-Seq與組織學的陽性預測值(PPV，HPV感染的可能性)總是大于細胞學與組織學的PPV。“與細胞學相比，這一觀察結果有利于HPV RNA-Seq可能增加的醫學價值，”Eloit教授評論道。

　　Eloit教授建議在某些患者中使用HPV RNA-Seq可以幫助消除不必要的陰道鏡檢查。

　　他還預測，技術將允許多個樣本同時運行，從而將每次測試的成本降低到10到20美元。該測試也可適用于其他HPV相關癌癥，例如肛門癌和頭頸癌。

　　HPV RNA-Seq基于多重逆轉錄PCR(RT-PCR)和下一代測序(NGS)的雙重組合。 RT-PCR是一種測量少量RNA(即反映HPV基因活性的遺傳物質)的敏感方法，NGS可以精確表征擴增的病毒序列的多樣性。這樣可以檢測一個樣品中多達16種高風險或假定的高風險HPV以及癌前標記物的存在。

　　“我們的方法遵循目前用于分子診斷的NGS擴增板的發展趨勢，同時保持適應傳統的分子檢測格式。這種靈活性可以使HPV RNA-Seq成為許多實驗室的一種方便、可靠且經濟實惠的解決方案，”主要作者、巴斯德研究所的Philippe Pérot博士補充說。